Les cisterciens - XIIe et XIIIe siècles.
A partir de cette époque, l'histoire de l'abbaye devient plus précise.
En 1098, Robert de Molesme fonde l'abbaye de Cîteaux. C'est là que se développe l'ordre cistercien, une branche réformée des bénédictins.
En 1147, le prince-évêque de Liège offre Aulne à St Bernard (1090-1153), avec mission d'y instaurer l'ordre cistercien. Les premiers cisterciens, venant de Clairvaux, arrivent à Aulne en décembre 1147.
La donation par le prince-évêque de Liège est confirmée par une charte en 1158.
Le village d'Aulne disparaît en 1205 : Hugues de Pierpont, prince-évêque de Liège lui aussi, par décret, ordonne aux habitants de céder tous leurs biens aux moines, sous peine d'excommunication.
L’église abbatiale est construite par les abbés Gilles de Beaumont (1214-1224) et Baudouin de Châtelet (12214-1247).